Poussé par Aldosi qu'il a épousé en secret, Jules II s'apprête à déclarer son amour au grand jour. Avant d'en informer la Chrétienté, il convoque le clan Rovere. Mais ces derniers s'unissent pour fomenter l'assassinat du favori. La découverte du cadavre transforme le pape en un monstre sanguinaire. Il jure alors de détruire tous ceux qui s'opposent à sa Sainte volonté, y compris sa propre famille.

Rome, 1513. Raphaël et Michel-Ange portent le cercueil du pape vers l'église de San Pietro, peinte en noir. Dans le même temps, Machiavel demande en mariage madame Imperia, la matrone de la maison close qu'il fréquente.

Dans la Rome des Borgia, le 18 août 1503, le Saint-Père Alexandre VI vient de mourir. La course au trône papal s'engage : népotisme, stupre, poison deviennent monnaie courante. En outre, le cardinal Della Rovere, ennemi juré du clan Borgia, entend bien accéder à la fonction suprême, quitte à vendre son âme au diable...

Machiavel, à son retour de guerre, se ressource en maison close. Il y raconte les campagnes victorieuses de Jules II. Tandis que Michel-Ange a accepté le chantier de la chapelle Sixtine, une autre bataille commence dans l'ombre pour l'organisation du prochain conclave.